В 1940—1941 г.г. Шеннон начал работать над своими идеями в области теории информации и систем связи. В это время ему было предложено участвовать в разработке систем наведения для зенитных орудий, это было особенно актуально для Англии, так как в это время Германия начала эффективно применять свои ракеты Фау-1 и Фау-2. Утверждается, что потери Англии в войне были бы существенно больше, если бы не эти системы наведения.
Следующие 15 лет Шеннон работал в различных областях, главным образом – в теории информации, началом которой послужила его статья «Математическая теория связи». В этой статье было показано, что любой источник информации – телеграфный ключ, говорящий человек, телекамера и так далее – имеет «темп производства информации», который можно измерить в битах в секунду. Каналы связи имеют «пропускную способность», измеряемую в тех же единицах; информация может быть передана по каналу тогда и только тогда, когда пропускная способность не меньше темпа поступления информации. Эта статья считается самым большим вкладом Клода Шеннона в науку.
В 1950 году он опубликовал статью, посвященную искусственному интеллекту, а также давшую толчок для развития соответствующих идей – «Программирование компьютера для игры в шахматы». В то время компьютеры были медленными, и программирование их было достаточно сложным. С тех пор создано множество шахматных программ, однако большинство из них и сейчас основаны на идеях этой работы.